Use of genomic tools for the study of the genetic basis of resistance to gastrointestinal nematode infections in adult sheep = Utilización de herramientas genómicas para el estudio de la base genética de la resistencia a las infecciones por nematodos gastrointestinales en ovejas adultas

Abstract

La actual tesis doctoral, que se ha desarrollado en el grupo de investigación de mejora genética animal de la Universidad de León (grupo MEGA-ULE), tiene como objetivo global el estudio de la base genética subyacente a la resistencia a los nematodos gastrointestinales (GIN) en ovejas adultas. Para ello se han utilizado metodologías empleadas en la genómica, tales como el chip de genotipado de SNPs de alta densidad (HD) y las tecnologías se cuenciación conocidas como next generation sequencing (NGS). Para el cumplimiento el objetivo global se han abordado dos objetivos específicos. El primero de ellos tuvo por objeto realizar un mapeo de alta densidad de regiones con influencia sobre la resistencia a los GIN en ovejas mediante el análisis de genotipos imputados para el chip HD-chip en una población de raza Churra previamente analizada con el chip de media densidad (50K-chip) y para la cual estaban disponibles datos de dos fenotipos relacionados con la carga parasitaria. El segundo objetivo específico se centró en la caracterización funcional de regiones genómicas asociadas con la resistencia a los GIN en ovejas adultas, utilizando el análsis del transcriptioma completo de diferentes tejidos (ganglio linfático abomasal y mucosa del abomaso) después de la infección experimental con T. circumcincta, mediante la metodología RNAseq.