La estructura de la Biblioteca de la Universidad de Ámsterdam es muy compleja ya que consiste en una Biblioteca Central, ubicada en el centro de la ciudad, y alrededor de otras veinte bibliotecas de Facultades, localizadas en diferentes zonas de Ámsterdam. Hace dos años se planteó el gran proyecto de construir un Campus único en el centro de la ciudad, donde se unieran todos los estudios y donde existieran sólo cuatro grandes bibliotecas de áreas temáticas. Los problemas económicos y las continuas protestas de los vecinos impidieron que el proyecto saliera adelante, por lo que en la actualidad, se sigue pensando en la unificación de puntos de servicio. La mayoría de las bibliotecas de Facultad se ubican en edificios antiguos, con mobiliario antiguo. Sólo la biblioteca central y la biblioteca de colecciones especiales cuentan con edificios rehabilitados.
