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Título
SARS-CoV-2 : análisis comparativo del genoma vírico durante 2020 y 2021 en Castilla y León, Madrid y Cataluña
Autor
Director/es
Facultad/Centro
Área de conocimiento
Titulación
- Grado en Biología
Cita Bibliográfica
Capellán Sanjuán, A. (2022). Sars-Cov-2: análisis comparativo del genoma vírico durante 2020 y 2021 en Castilla y León, Madrid y Cataluña. [Trabajo de fin de Grado, Universidad de León].
Fecha
2022-07-08
Resumen
[ES] En este estudio se han analizado y comparado secuencias del genoma de SARS-CoV-2 entre 2020 y 2021 provenientes de Castilla y León, Madrid y Cataluña dentro de la plataforma GISAID. Los resultados indican que la tasa de mutación media se incrementa hasta 5 veces en el periodo estudiado; Castilla y León tiene los valores más altos, mientras que Madrid tiene los más bajos. El gen orf8 es el que más tasa de mutación tiene y más tendencia tiene a cambiar los aminoácidos para los que codifica, mientras que los genes orf6, e y m son los que menos cambian. El porcentaje medio de transiciones siempre supera a las transversiones y deleciones en las tres comunidades autónomas. La proporción entre mutaciones no sinónimas y sinónimas se ha mantenido relativamente constante entre todas las comunidades. La selección media del genoma (dN/dS) es purificadora en 2020 y positiva en 2021. Las mutaciones predominantes en ambos años son: C3037T (orf1ab: F106F), C14408T (orf1ab: P323L) y A23403G (spike: D614G) [EN] In this study, SARS-CoV-2 genome sequences from Castilla y Leon, Madrid and Catalonia have been analyzed and compared between 2020 and 2021 within the GISAID platform. The results indicate that the average mutation rate increases up to 5 times within the period; Castilla y León has the highest values, while Madrid has the lowest. The orf8 gene has the highest mutation rate and tendency to change its encoded amino acids, while the orf6, e and m genes are the ones that change the least. The average percentage of transitions in the three autonomous communities always exceeds transversions and deletions. Non-synonymous to synonymous ratio has been maintained constant in all sequences and time periods. The genome average selection (dN/dS) is purifying in 2020 and positive in 2021. The most common mutations on both periods are: C3037T (orf1ab: F106F), C14408T (orf1ab: P323L) and A23403G (spike: D614G)
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