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Título
Análisis filogenético de arqueas amonio-oxidantes enfocado en la evolución de los genes del operón amo.
Autor
Director/es
Facultad/Centro
Área de conocimiento
Titulación
- Grado en Biotecnología
Fecha
2020-09
Abstract
Las arqueas oxidantes del amonio (AOA) son fundamentales en el desarrollo del ciclo
biogeoquímico del nitrógeno. Este proceso metabólico está catalizado por la enzima Amo, la
cual está formada por 3 subunidades: AmoA, AmoB y AmoC. El gen amoA es el segundo gen
más empleado como marcador genético para estudios filogenéticos y como herramienta de
clasificación taxonómica. El objetivo del trabajo es analizar la filogenia de distintas especies
de AOA del grupo Thaumarchaeota en relación con estos tres genes, junto a dos genes
esenciales para el metabolismo, los que codifican para las enzimas Aconitasa y Acetil-CoA
sintetasa, y con el gen codificante para el RNA ribosomal 16S rRNA. Otro objetivo es
determinar la posición filogenética de las especies estudiadas, con relación a arqueas del
Grupo Asgard, como Prometheoarchaeum. Para este análisis se establece un pipeline
mediante herramientas bioinformáticas que permita automatizar parte del proceso. Este junto
con otras herramientas bioinformáticas facilita la elaboración de análisis filogenéticos que
discuten la utilidad de amoA, muestran la naturaleza del gen amoB, y sugieren la importancia
de la transferencia genética horizontal en los procesos evolutivos.
Materia
Palabras clave
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