Análisis filogenético de arqueas amonio-oxidantes enfocado en la evolución de los genes del operón amo.

Abstract

Las arqueas oxidantes del amonio (AOA) son fundamentales en el desarrollo del ciclo biogeoquímico del nitrógeno. Este proceso metabólico está catalizado por la enzima Amo, la cual está formada por 3 subunidades: AmoA, AmoB y AmoC. El gen amoA es el segundo gen más empleado como marcador genético para estudios filogenéticos y como herramienta de clasificación taxonómica. El objetivo del trabajo es analizar la filogenia de distintas especies de AOA del grupo Thaumarchaeota en relación con estos tres genes, junto a dos genes esenciales para el metabolismo, los que codifican para las enzimas Aconitasa y Acetil-CoA sintetasa, y con el gen codificante para el RNA ribosomal 16S rRNA. Otro objetivo es determinar la posición filogenética de las especies estudiadas, con relación a arqueas del Grupo Asgard, como Prometheoarchaeum. Para este análisis se establece un pipeline mediante herramientas bioinformáticas que permita automatizar parte del proceso. Este junto con otras herramientas bioinformáticas facilita la elaboración de análisis filogenéticos que discuten la utilidad de amoA, muestran la naturaleza del gen amoB, y sugieren la importancia de la transferencia genética horizontal en los procesos evolutivos.