Utilización de herramientas bioinformáticas para el análisis evolutivo de la familia génica pmoCAB

Abstract

[ES] En este trabajo se ha realizado un análisis evolutivo de los genes que codifican para la enzima metano-moonoxigenasa presente en bacterias de diversos géneros y especies gracias al empleo de herramientas bioinformáticas y búsquedas en base de datos. Se ha empleado la base de datos del NCBI para buscar las secuencias de los genes pmoCAB, los responsables de codificar las metano-monooxigenasas. Los datos obtenidos se han empleado para generar alineamientos de secuencias y posteriormente filogramas que son representaciones gráficas en forma de árboles que permiten realizar una comparación evolutiva entre las distintas metano-monooxigenasas y el ARN 16S ribosomal que permite conocer la relación filogenética de las especies. Con la comparación de los árboles resultantes se ha podido conocer las distintas relaciones de ortología y paralogía dadas entre los genes codificantes de las proteínas analizadas o las duplicaciones existentes durante el proceso evolutivo. Otra información que podemos extraer del análisis nos permite conocer los puntos donde es posible que se diera una transferencia horizontal y entre qué grupos taxonómicos

[EN] In this study, an evolutionary analysis of genes encoding the methane monooxygenase enzyme in bacteria from various genera and species was conducted using bioinformatic tools and database searches. The NCBI database was used to search for the sequences of pmoCAB genes, which encode methane monooxygenases. The obtained data were used to generate sequence alignments and subsequently phylogenetic trees, which are graphical representations in the form of trees that allow for evolutionary comparisons among different methane monooxygenases and the 16S ribosomal RNA, providing insight into the phylogenetic relationship of the species. By comparing the resulting trees, it has been possible to determine the different orthology and paralogy relationships among the coding genes of the analyzed proteins or the existing duplications during the evolutionary process. Another piece of information that can be extracted from the analysis allows us to identify the points where horizontal transfer could have occurred and between which taxonomic groups